MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 101673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015564	C	6	6	47807	47812	0 %	0 %	0 %	100 %	333917721
1002	NC_015564	TCG	2	6	47859	47864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917721
1003	NC_015564	TCAC	2	8	47895	47902	25 %	25 %	0 %	50 %	333917721
1004	NC_015564	CTT	2	6	47914	47919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015564	TGA	2	6	47958	47963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015564	CGT	2	6	47981	47986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015564	GGT	2	6	48004	48009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917722
1008	NC_015564	CG	3	6	48062	48067	0 %	0 %	50 %	50 %	333917722
1009	NC_015564	CGTT	2	8	48120	48127	0 %	50 %	25 %	25 %	333917722
1010	NC_015564	CAG	2	6	48181	48186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917722
1011	NC_015564	GCA	2	6	48291	48296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917722
1012	NC_015564	CTGG	2	8	48312	48319	0 %	25 %	50 %	25 %	333917722
1013	NC_015564	GGC	2	6	48363	48368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917722
1014	NC_015564	GGC	2	6	48403	48408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917722
1015	NC_015564	CGA	2	6	48411	48416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917722
1016	NC_015564	GC	3	6	48551	48556	0 %	0 %	50 %	50 %	333917722
1017	NC_015564	GC	3	6	48739	48744	0 %	0 %	50 %	50 %	333917722
1018	NC_015564	CAACCG	2	12	48786	48797	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917722
1019	NC_015564	GT	3	6	48835	48840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015564	GTG	2	6	48886	48891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015564	GCT	2	6	48986	48991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1022	NC_015564	CG	3	6	49009	49014	0 %	0 %	50 %	50 %	333917723
1023	NC_015564	CGC	2	6	49027	49032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917723
1024	NC_015564	GA	3	6	49053	49058	50 %	0 %	50 %	0 %	333917723
1025	NC_015564	CGA	2	6	49098	49103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1026	NC_015564	CAA	2	6	49207	49212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917723
1027	NC_015564	GTT	2	6	49246	49251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917723
1028	NC_015564	CTA	2	6	49330	49335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917723
1029	NC_015564	CG	3	6	49336	49341	0 %	0 %	50 %	50 %	333917723
1030	NC_015564	AGA	2	6	49365	49370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917723
1031	NC_015564	GAC	2	6	49402	49407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1032	NC_015564	GTC	2	6	49430	49435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1033	NC_015564	CTG	2	6	49496	49501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1034	NC_015564	AGGC	2	8	49578	49585	25 %	0 %	50 %	25 %	333917723
1035	NC_015564	GTC	2	6	49628	49633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1036	NC_015564	TGG	2	6	49644	49649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917723
1037	NC_015564	CAT	2	6	49663	49668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917723
1038	NC_015564	CGG	2	6	49747	49752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917723
1039	NC_015564	TCG	2	6	49767	49772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1040	NC_015564	CGC	2	6	49879	49884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917723
1041	NC_015564	CTG	2	6	49935	49940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1042	NC_015564	TCTCA	2	10	49969	49978	20 %	40 %	0 %	40 %	333917723
1043	NC_015564	TCG	2	6	50007	50012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1044	NC_015564	GGC	2	6	50048	50053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917723
1045	NC_015564	CTT	2	6	50080	50085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917723
1046	NC_015564	GCT	2	6	50095	50100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917723
1047	NC_015564	GAT	2	6	50119	50124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917723
1048	NC_015564	CGGTC	2	10	50146	50155	0 %	20 %	40 %	40 %	333917723
1049	NC_015564	CGG	2	6	50449	50454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917723
1050	NC_015564	GCTG	2	8	50460	50467	0 %	25 %	50 %	25 %	333917723
1051	NC_015564	GC	3	6	50506	50511	0 %	0 %	50 %	50 %	333917723
1052	NC_015564	ACG	2	6	50540	50545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015564	CGGT	2	8	50557	50564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_015564	TTC	2	6	50566	50571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015564	GGT	2	6	50591	50596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015564	ACG	2	6	50639	50644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917724
1057	NC_015564	TCG	2	6	50708	50713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917724
1058	NC_015564	CG	3	6	50794	50799	0 %	0 %	50 %	50 %	333917724
1059	NC_015564	ACG	2	6	50834	50839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917724
1060	NC_015564	CTT	2	6	50991	50996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917724
1061	NC_015564	AAT	2	6	51061	51066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015564	CAT	2	6	51154	51159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015564	GC	3	6	51168	51173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_015564	AAC	2	6	51230	51235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917725
1065	NC_015564	TGT	2	6	51252	51257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917725
1066	NC_015564	CCG	2	6	51277	51282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917725
1067	NC_015564	GGC	2	6	51346	51351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917725
1068	NC_015564	TGG	2	6	51352	51357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917725
1069	NC_015564	GGCT	2	8	51378	51385	0 %	25 %	50 %	25 %	333917725
1070	NC_015564	ACGC	2	8	51430	51437	25 %	0 %	25 %	50 %	333917725
1071	NC_015564	CGC	2	6	51454	51459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917725
1072	NC_015564	CGTA	2	8	51461	51468	25 %	25 %	25 %	25 %	333917725
1073	NC_015564	TGA	2	6	51632	51637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917725
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1075	NC_015564	TGC	2	6	51720	51725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1076	NC_015564	ACG	2	6	51768	51773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1077	NC_015564	CGC	2	6	51791	51796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917726
1078	NC_015564	CTA	2	6	51803	51808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917726
1079	NC_015564	CGC	2	6	51826	51831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917726
1080	NC_015564	CAC	2	6	51832	51837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917726
1081	NC_015564	AGA	2	6	51928	51933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917726
1082	NC_015564	GGC	2	6	51981	51986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1083	NC_015564	CG	3	6	52023	52028	0 %	0 %	50 %	50 %	333917726
1084	NC_015564	GCG	2	6	52051	52056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1085	NC_015564	AGC	2	6	52057	52062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
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1087	NC_015564	CGG	2	6	52082	52087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1088	NC_015564	AGG	2	6	52162	52167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917726
1089	NC_015564	CA	3	6	52170	52175	50 %	0 %	0 %	50 %	333917726
1090	NC_015564	CGA	2	6	52198	52203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1091	NC_015564	GGC	2	6	52220	52225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1092	NC_015564	ACC	2	6	52228	52233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917726
1093	NC_015564	TCG	2	6	52321	52326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1094	NC_015564	GCA	2	6	52393	52398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1095	NC_015564	CCG	2	6	52434	52439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917726
1096	NC_015564	CG	3	6	52447	52452	0 %	0 %	50 %	50 %	333917726
1097	NC_015564	AGC	2	6	52486	52491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1098	NC_015564	GAC	2	6	52518	52523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1099	NC_015564	GGC	2	6	52554	52559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1100	NC_015564	CAT	2	6	52568	52573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917726
1101	NC_015564	GCC	2	6	52602	52607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917726
1102	NC_015564	GAC	2	6	52608	52613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1103	NC_015564	CGG	2	6	52622	52627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1104	NC_015564	TGA	2	6	52687	52692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917727
1105	NC_015564	GCC	2	6	52711	52716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917727
1106	NC_015564	CCT	3	9	52770	52778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917727
1107	NC_015564	CGGAG	2	10	52807	52816	20 %	0 %	60 %	20 %	333917727
1108	NC_015564	CGC	2	6	52854	52859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917727
1109	NC_015564	CGG	2	6	52866	52871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917727
1110	NC_015564	CAG	2	6	52911	52916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1111	NC_015564	GCT	2	6	52949	52954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1112	NC_015564	GTC	2	6	53002	53007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1113	NC_015564	CTTCCA	2	12	53106	53117	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333917727
1114	NC_015564	GGCG	2	8	53161	53168	0 %	0 %	75 %	25 %	333917727
1115	NC_015564	TCA	2	6	53184	53189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917727
1116	NC_015564	CGA	2	6	53196	53201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1117	NC_015564	CA	3	6	53211	53216	50 %	0 %	0 %	50 %	333917727
1118	NC_015564	ACG	2	6	53227	53232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1119	NC_015564	CGC	2	6	53316	53321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917728
1120	NC_015564	GC	3	6	53329	53334	0 %	0 %	50 %	50 %	333917728
1121	NC_015564	GTC	2	6	53338	53343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917728
1122	NC_015564	CG	3	6	53352	53357	0 %	0 %	50 %	50 %	333917728
1123	NC_015564	TAG	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917728
1124	NC_015564	CTC	2	6	53434	53439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917728
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1126	NC_015564	GCC	2	6	53477	53482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917728
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1235	NC_015564	CACC	2	8	58459	58466	25 %	0 %	0 %	75 %	333917733
1236	NC_015564	GAT	2	6	58618	58623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917733
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1239	NC_015564	GCT	2	6	58943	58948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1240	NC_015564	CCAT	2	8	59008	59015	25 %	25 %	0 %	50 %	333917734
1241	NC_015564	ATC	2	6	59053	59058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917734
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1243	NC_015564	CGA	2	6	59168	59173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917734
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1245	NC_015564	CATGC	2	10	59238	59247	20 %	20 %	20 %	40 %	333917734
1246	NC_015564	GTC	2	6	59343	59348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917734
1247	NC_015564	GCG	2	6	59377	59382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917734
1248	NC_015564	ACG	2	6	59422	59427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917734
1249	NC_015564	CTTG	2	8	59456	59463	0 %	50 %	25 %	25 %	333917734
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1251	NC_015564	TGC	2	6	59727	59732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917734
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1500	NC_015564	CG	3	6	70066	70071	0 %	0 %	50 %	50 %	333917748

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